Bagaimana Membuat Anda Lebih Mudah Mempelajari Epidemiologi Penyakit Tumbuhan?

Perkembangan Penyakit dalam Waktu.
Sumber: APSNet

Saya sudah mengampu matakuliah Epidemiologi Penyakit Tumbuhan sejak Program Studi Ilmu Hama dan Penyakit Tumbuhan didirikan. Sekarang, ketika Program Studi Ilmu Hama dan Penyakit Tumbuhan sudah dibubarkan, saya masih mengampu matakuliah yang sama sebagai pilihan pada minat Perlindungan Tanaman. Selama saya mengampu matakuliah ini, saya sudah berusaha sebisa mungkin untuk membuat matakuliah ini lebih mudah dipahami mahasiswa. Namun kenyataannya, tidak selamanya upaya saya berhasil. Bahkan, kalau saya boleh jujur, lebih banyak yang gagal. Maka, kalau saya masih boleh berharap, tolonglah saya, Anda parapeserta kuliah Epidemiologi Penyakit Tumbuhan, berusaha lebih serius belajar. Sebab tanpa upaya bersama, tidak mungkin saya dapat membuat Anda menguasai dengan baik matakuliah ini.


Epidemiologi Penyakit Tumbuhan (EPT) merupakan matakuliah untuk mempelajari cara “mengukur” penyakit. Dalam bahasa EPT, mengukur adalah mengkuantifikasi penyakit. Hal ini membedakan EPT dengan Ilmu Penyakit Tumbuhan. Matakuliah Ilmu Penyakit Tumbuhan mempelajari cara “mendeskripsikan” penyakit. Untuk mempelajari cara mengukur maka Anda perlu terlebih dahulu memahami skala pengukuran. Ada empat skala pengukuran, yaitu nominal, ordinal, interval, dan rasio. Nominal merupakan ukuran yang sekedar bersifat membedakan, ordinal bersifat membedakan dan memeringkatkan, interval bersifat membedakan dan memeringkatkan dengan jarak yang sama, dan rasio bersifat membedakan, memeringkatkan dengan jarak yang sama, dan menggunakan angka 0 untuk menyatakan tidak ada. Laki-laki dan perempuan adalah skala nominal, skor 1, 2, dan 3 adalah skala ordinal, suhu 0oC dan 100oC adalah skala interval, dan jumlah tanaman sakit sebanyak 0 tanaman dan 5 tanaman per petak adalah skala rasio.

EPT mengkuantifikasi penyakit dengan menggunakan keempat skala ini. Pernyataan tanaman sakit dan tanaman sehat merupakan kuantifikasi berskala nominal yang masing-masing dapat dinyatakan sebagai 1 dan 0. Pernyataan tanaman sakit ringan, sedang, dan parah merupakan kuantifikasi berskala ordinal yang dapat diberikan skor 1, 2, dan 3. Pernyataan Ca. Liberibacter asiaticus lebih parah di daerah beiklim panas daripada di daerah beriklim dingin merupakan kuantifikasi skala interval. Pernyataan bahwa 5 dari 20 tanaman per petak bergejala penyakit merupakan kuantifikasi berskala rasio. Dalam menggunakan berbagai skala pengukuran untuk mengkuantifikasi penyakit tentu saja tidak boleh dicampuradukkan berbagai skala pengukuran ini. Tetapi dalam kenyataannya, percaya atau tidak, hal ini dilakukan bukan hanya oleh orang yang baru belajar EPT tetapi oleh orang yang berpendidikan lanjut setingkat S2 dan S3.

Simak misalnya penggunaan rumus Intensitas (%)=(∑▒〖(n x v)〗)/(Z x N) x 100. Dalam rumus ini n adalah jumlah satuan yang diberikan skor tertentu, v adalah skor tertentu yang diberikan kepada satuan tertentu, Z adalah skor yang ditetapkan tertinggi, dan N adalah jumlah seluruh satuan yang diamati untuk diberikan skor. Rumus ini mengubah skor yang berskala ordinal menjadi persentase yang berskala rasio. Di negeri ini rumus ini seakan-akan telah menjadi rumus sakti mandraguna yang tidak boleh dipertanyakan, padahal coba saja cari referensinya pada jurnal terkemuka semisal Phytopathology atau Plant Disease, apakah akan ditemukan atau tidak. Meskipun berbagai buku teks EPT telah menjelaskan cara pengukuran penyakit sebagai insidensi penyakit (disease incidence) dan severitas atau keparahan penyakit (disease severity), rumus intensitas di atas tetap saja digunakan secara membabi buta.

Insidensi penyakit mengukur penyakit sebagai perbandingan antara jumlah seluruh individu atau organ berpenyakit terhadap jumlah seluruh individu atau organ. Misalkan bila dalam satu petak yang terdiri atas 20 tanaman maka insidensi individu tanaman sakit adalah 5/20 atau 25%. Bila tanaman yang memiliki 20 daun ternyata 4 di antara daunnya berpenyakit maka tanaman tersebut menderita penyakit dengan insidensi 4/20 atau 20%. Insidensi penyakit memang merupakan kuantifikasi penyakit yang kurang teliti, tetapi baik digunakan untuk mengukur penyakit-penyakit semacam rebah kecambah dan penyakit-penyakit sistemik. Severitas penyakit mengukur penyakit sebagai perbandingan antara luas permukaan atau volume organ tanaman bergejala penyakit terhadap luas permukaan atau volume total organ yang bersangkutan. Bila satu helai tanaman ternyata ¼ luas permukaannya ditutupi oleh bercak daun maka severitas penyakit bercak daun pada daun tersebut adalah 25%. Karena definisi ini maka pengukurannya menjadi tidak mudah. Pengukuran secara teliti dapat dilakukan secara destruktif dengan menggunakan, antara lain, leaf area meter, sedangkan pengukuran di lapangan pada umumnya dilakukan dengan penaksiran menggunakan bantuan diagram berskala.

Selain untuk mempelajari cara pengukuran penyakit, EPT juga diperlukan untuk menganalisis perkembangan penyakit dalam waktu dan ruang. Artinya, dalam EPT perkembangan penyakit diukur dari satu waktu ke waktu berikutnya dan dari satu titik pada suatu tempat ke titik lainnya pada tempat yang bersangkutan. Analisis perkembangan penyakit ini diperlukan untuk menjawab pertanyaan seberapa cepat suatu penyakit berkembang dan menyebar. Katakan misalnya dilakukan pengukuran severitas penyakit bercak daun dini kacang tanah sebanyak lima kali dengan tenggang waktu masing-masing 3 hari dalam percobaan uji ketahanan 5 kultuivar kacang tanah menggunakan rancangan acak kelompok dalam 4 ulangan. Untuk menjawab pertanyaan seberapa cepat penyakit ini berkembang tentu saja tidak dapat dilakukan dengan hanya menganalisis ragam data severitas setiap kali pengamatan. Teknik analisis yang paling mudah sebenarnya adalah menghitung luas daerah di bawah kurva perkembangan penyakit (area under the disease progress curves) untuk menginterasikan severitas penyakit dengan waktu. Teknik analisis lain yang dapat digunakan adalah memodelkan perkembangan penyakit dengan cara menyuai model monomolekuler, logistik, atau Gompertz. Pendekatan yang serupa juga dapat dilakukan terhadap perkembangan penyakit dalam ruang.

Untuk mempelajari ini semua memang diperlukan dasar matematika dan statistika yang memadai. Dan yang lebih penting adalah kemauan untuk belajar, kemauan untuk berubah dari keadaan kurang tahu menjadi keadaan lebih tahu. Kemauan untuk menukar kepemilikan rumah mewah, mobil mewah, dan ponsel mewah dengan pencerahan pikiran sebagai status sosial. Tapi dalam era ketika status sebagai koruptor tidak lagi membuat orang menjadi malu, ketika merebut jabatan untuk kepentingan pribadi dan kelompok menjadi ukuran keberhasilan, ketika mengumbar janji tanpa takut merasa telah berbohong merupakan cara berkampanye yang dianggap patut, maka pencerahan pikiran tidak lagi menjadi sesuatu yang terlalu menjadi persoalan. Yang penting adalah gelar SP universitas berwawasan global dan pesta wisuda, peduli amat dengan EPT, matematika, dan statistika.